สำนักหอสมุด มหาวิทยาลัยแม่โจ้ มีความร่วมมือทางวิชาการกับหน่วยงานภายนอก ดังนี้
โครงการพัฒนาเครือข่ายห้องสมุดในประเทศไทย (ThaiLIS)
โครงการสหบรรณานุกรม (Union Catalog)
โครงการจัดเก็บเอกสารในรูปอิเล็กทรอนิกส์ (Thai Digital Collection)
โครงการบริการฐานข้อมูลอิเล็กทรอนิกส์ (Reference Database)
ข่ายงานห้องสมุดมหาวิทยาลัยส่วนภูมิภาค (PULINET)
ความร่วมมือระหว่างห้องสมุดสถาบันอุดมศึกษา
ชมรมห้องสมุดเชียงใหม่
สำนักงานส่งเสริมเศรษฐกิจสร้างสรรค์ (องค์กรมหาชน) โครงการ miniTCDC Link
